В основу сценария лег роман Александра Тамоникова «Рота уходит в небо» о событиях Чеченской войны. Роман вышел в 2005 году, когда сам писатель уже давно покинул горячие точки — до 1985 года он служил в Центральной группе войск и в Туркестанском военном округе, участвовал в боевых действиях. В 90-х начал писать военную и детективную прозу — сначала публицистику, а потом и художественные произведения. Тамоников стал членом Союза писателей и Международной Ассоциации писателей баталистов и маринистов, но широкая известность к нему пришла только после выхода сериала «Грозовые ворота» — единственной экранизации его книг.

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

В событиях романа много пересечений с реальными событиями. В частности, с боем у высоты 776 — 1 марта 2000 года 90 бойцов из 6-й парашютно-десантной роты псковской дивизии ВДВ прикрыли собой дорогу на Дагестан недалеко от чеченского горного села Улус-Керт. Они сдержали напор двухтысячной армии боевиков ценой собственной жизни — в живых осталось только шестеро военнослужащих.

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

Режиссёром экранизации стал режиссёр Андрей Малюков, который уже не раз обращался к военной теме. Он начал карьеру ассистентом режиссёра на съёмках эпопеи «Освобождение», его первой самостоятельной работой стал боевик «В зоне особого внимания», а в начале нулевых снял популярные сериалы «Спецназ» и «Диверсант».

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

Первым названием сериала было «6-я рота», но параллельно с его съёмками режиссёр Фёдор Бондарчук начал работу над своим фильмом «9 рота» о подвиге десантников в время войны в Афганистане. Помимо схожих сюжетов, в обеих картинах снимались Михаил Пореченков, Андрей Краско и Михаил Ефремов, поэтому было решено изменить название на «Грозовые ворота», чтобы не путать зрителей.

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

Городские сцены снимали в Пскове, на базе отдыха в посёлке Кривск и на территории 76-й гвардейской десантно-штурмовой дивизии. В части сцен участвовали настоящие псковские десантники, они также работали с актёрами — обучали строевой подготовке и тренировали на полосе препятствий, причем в полном боевом снаряжении. Потом актёры рассказывали, что съёмки были тяжелыми даже для хорошо тренированных участников — ранние подъёмы, настоящие марш-броски по горам, перепады температур и погодные сюрпризы выматывали физически и морально.

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

Погодные сюрпризы почти все достались Даниилу Страхову — как только он входил в кадр, начинались песчаные бури или поднимался ураганный ветер, а игравшему чеченца Шаха актёру Вячеславу Разбегаеву съёмки чуть не стоили здоровья — запущенная пиротехниками ракета пролетела не в заданном направлении, а в паре сантиметров от его головы. Вся съёмочная площадка замерла в испуге, а режиссёр оставил в фильме именно этот дубль.

«Грозовые ворота», к/с «Вертикаль», 2006, реж. А. Малюков

Кавказские и боевые сцены были сняты Краснодарском крае, а саму крепость «Грозовые ворота» построили на горе Абин недалеко от Геленджика. Старинные стены с фресками и пулевыми отверстиями на самом деле были из современных пеноблоков, над которыми поработали декораторы. После съёмок крепость не стали разбирать, и она стала туристической достопримечательностью. В 2025 году декорация была разрушена вандалами и над её восстановлением работали арендатор территории и местные волонтеры.